Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SERPINA1P01009 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SERPINA1P01009 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms