Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms