Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIX3O95343 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SIX3O95343 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIX3O95343 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIX3O95343 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SIX3O95343 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SIX3O95343 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SIX3O95343 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX3O95343 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SIX3O95343 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SIX3O95343 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SIX3O95343 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SIX3O95343 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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