Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF10O60809 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF10O60809 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PRAMEF10O60809 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PRAMEF10O60809 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF10O60809 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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