Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GMDSO60547 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GMDSO60547 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GMDSO60547 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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