Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KDELR3O43731 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR3O43731 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms