Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SETD1AO15047 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms