Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms