Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E9PBE3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E9PBE3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E9PBE3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms