Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RGPD3A6NKT7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms