Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX7Q9UNH6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms