Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MKLN1Q9UL63 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms