Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUCLA2Q9P2R7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms