Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMBRD1Q9NUN5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms