Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMMDC1Q9NPL8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms