Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM38Q9H0Z9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBM38Q9H0Z9 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBM38Q9H0Z9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RBM38Q9H0Z9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBM38Q9H0Z9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBM38Q9H0Z9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RBM38Q9H0Z9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM38Q9H0Z9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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