Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP44Q9C0F1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms