Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF518BQ9C0D4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms