Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCGF6Q9BYE7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms