Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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KATNB1Q9BVA0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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KATNB1Q9BVA0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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KATNB1Q9BVA0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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KATNB1Q9BVA0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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KATNB1Q9BVA0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KATNB1Q9BVA0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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