Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf16Q9BUW7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms