Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNS3Q9BQ31 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms