Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PRPF18Q99633 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRPF18Q99633 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms