Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3IPQ96QF0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms