Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC7Q96M83 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms