Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms