Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRUQ92729 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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PTPRUQ92729 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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PTPRUQ92729 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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