Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM41Q8WV44 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM41Q8WV44 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms