Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AVL9Q8NBF6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms