Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTC29Q8NA56 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms