Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms