Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3K6

MIER3, Mesoderm induction early response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIER3Q7Z3K6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MIER3Q7Z3K6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms