Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms