Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPOCD1Q6ZMY3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms