Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUX4L9Q6RFH8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DUX4L9Q6RFH8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms