Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC174Q6PII3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms