Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NANOGP8Q6NSW7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms