Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms