Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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