Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms