Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFT2D3Q587I9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms