Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC92Q53HC0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms