Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms