Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC142Q17RM4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC142Q17RM4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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