Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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VAMP3Q15836 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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