Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TAF11Q15544 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TAF11Q15544 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TAF11Q15544 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TAF11Q15544 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms