Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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