Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCOLCEQ15113 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms