Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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