Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SMCO1Q147U7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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